当前农村水利最主要面临的问题是农村税费改革“两工”即将完全取消，实行一事一议，这对农村水利发展带来多方面的不利影响：项目的落实增加了许多不确定因素，规划的村组以上的项目可能通不过“一事一议”；地方财政难以承担起取消两工带来的资金缺口；农村干部人心不齐,水利建设组织难度增加。